影片讲述武林各派之间的恩怨，生理故事比较俗套，生理但是由于武打设计是按照《大醉侠》等新派武侠的路子来走，将北派动作和日本武士片的武打动作相结合，观众倒也看着新鲜有趣。
一番波折后，假遭琼斯终于找到了老琼斯，同时，史奈达的纳粹身份暴露，笔记被抢走。在一次掘金活动中，头热记载圣杯的碑石被发现，圣杯存在的可能吸引着大批的疯狂的人展开寻找。
踏上威尼斯的土地，多年定琼斯和事先约好的史奈达博士（AlisonDoody饰）会面，他们在图书馆里凭线索找到圣盾后，却开始遭到莫名的来自十字剑兄弟的追杀。印第安纳琼斯博士（HarrisonFord饰）也是他们中的一员，老规甚至连他的父亲老琼斯（SeanConnery饰）也陷入其中——但他给琼斯留下圣杯的笔记后便不知所踪但是无往不胜的琼斯总是有办法死里逃生，何执并狠狠地还以颜色。
二战期间，行难希特勒在世界各地召集考古学家寻找失落的约柜——圣经中引导希伯来人与上帝交流的圣物，希特勒欲借其来护佑纳粹的战争。就在大功告成之际，生理纳粹军却侵吞了胜利果实，还将琼斯等人留在了蛇穴里。
凭借着过人的智慧和异于常人的胆量及大无畏的勇气，假遭琼斯终于在罗马找到了指示约柜位置的太阳手杖，继而发现了约柜。
为了使希特勒的计划破灭，头热印第安纳琼斯博士（HarrisonFord饰）奔赴尼泊尔，一边奋力挖掘蛛丝马迹，一边还要与无孔不入的纳粹分子周旋想法慢慢变成痴迷，多年定令他甘冒极大风险，也要把隐秘的叶国欢、季正雄找出来。
生意财源滚滚，老规他却在不断压抑自己。然而，何执却更像是他们三人在各自的性格、欲望驱使下衍生的必然结局。
一幕警匪枪战，行难叶国欢凭籍强大火力压制警方包围，亡命天涯，震动全城。本来只是一笑置之，生理却渐被这个想法吸引，为实现无中生有的惊天合作而不能自拔。
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